Gyakran érik támadások a hallgatói önkormányzatokat pénzügyeiket illetően, elsősorban gazdálkodásuk átláthatatlansága miatt.
Ez ellen kívánt tenni az ELTE ÁJK hallgatói önkormányzata azzal, hogy Bubla Áron HÖK elnök kezdeményezésére elfogadtak egy határozatot, mely szerint az ösztöndíjjal jutalmazott hallgatók nyilatkozattal hozzájárulhatnak a nevük, a számukra kiutalt pénzösszeg és annak jogcíme nyilvánosságra hozatalához.
Ugyanakkor az átláthatóság megteremtése is csak a szabályok keretei között történhet meg, így Dr. Rónay Zoltán ELTE főtitkár észrevételei mellett a határozat felfüggesztésre került, és a HÖK ELTE-szinten látott hozzá a megfelelő körülmények kialakításához, hogy az ösztöndíjak kifizetéséről a személyiségi jogok és az egyenlő elbánás elvének megsértése nélkül lehessen képet adni.
Az ELTE-n a HÖK-ök közül is jó példával a TTK HÖK jár elöl évek óta tételes beszámolással és magyarázattal, de Rónay Zoltán főtitkár útmutatása mellett minden HÖK megkezdi a felzárkózást. Az ELTE Egyetemi Hallgatói Önkormányzat és a Kollégiumi Hallgatói Részönkormányzat esetében például a tisztségviselői ösztöndíjak összegéről, nem pedig annak nyilvánosságáról hozott határozatot az ELTE HÖK Küldöttgyűlése – melynek tagjai a részönkormányzatok által delegált képviselők, és az ELTE HÖK elnöke – 2010. júniusában. Mivel a küldöttgyűlési határozatok nyilvánosak, ezért az ELTE EHÖK tisztségviselőinek járó ösztöndíjak összege is nyilvános. A maximális havi juttatások mértéke azóta is változatlan:
| EHÖK | |
| EHÖK Elnökségi tagok | 30ezer Ft |
| EHÖK Elnök | 90ezer Ft |
| Kabinetfőnök | 70ezer Ft |
| Alelnökök | 70ezer Ft |
| Referensek | 45ezer Ft |
| Elnöki megbízott | 30ezer Ft |
| Ellenőrző Bizottság tagja | 25ezer Ft |
| Ellenőrző Bizottság elnöke | 40ezer Ft |
| EHÖK doktorandusz képviselő | 30ezer Ft |
| HÖOK elnökségi tag | 50ezer Ft |
| HÖOK választmányi tag | 35ezer Ft |
| Kollégiumi Hallgatói Önkormányzat | |
| Elnök | 60ezer Ft |
| Alelnökök | 40ezer Ft |
| Referensek | 30ezer Ft |
| Titkár | 30ezer Ft |
| Kollégiumi Diákbizottságok elnökei | 25ezer Ft |
Az ELTE EHÖK referensei és megbízottjai munkájukról rendszeresen beszámolnak az ELTE EHÖK elnökének, az ELTE EHÖK elnöke az ő nevükben is beszámol az ELTE HÖK elnökségének és a Küldöttgyűlésnek. Az EHÖK alelnökei külön, szakterületenként számolnak be a Küldöttgyűlésnek és az elnökségnek. Pozíciójukat és ezzel az ösztöndíjat mindannyian munka- és programterv leadásával, pályázati úton nyerik el, míg a beszámolók alapján a Küldöttgyűlés értékeli munkájukat és egyben azt, hogy ösztöndíjukra továbbra is jogosultak-e.
